Skip to main content
  • EN
  • Home
  • Forums
  • FME Form
  • Integration
  • I am trying to install a custom python package to a specific folder. I am using the code as specified by Safe to install a package (see details). [x] is my folder path The result: invalid syntax error. Don't see what's going wrong...

First lines of code: 

class TROPOMI(object):
 
  # Installs geemap package
 
  fme.exe python -m pip install geemap --target lx]
 
 
  import fme
 
  import fmeobjects
 
  import ee
 
  import geemap
 
  import os

 

First of all, line 5 isn't valid Python. You cannot execute fme.exe like that.

Secondly, when using fme.exe to install Python packages, make sure that you install for the same version of the Python interpreter that you'll be using in your workspace. You can force a specific Python version by appending either FME_PYTHON_VERSION 27 or FME_PYTHON_VERSION 37 at the end of the command, e.g.

fme.exe python -m pip install geemap --target .x] FME_PYTHON_VERSION 37

 

First of all, line 5 isn't valid Python. You cannot execute fme.exe like that.

Secondly, when using fme.exe to install Python packages, make sure that you install for the same version of the Python interpreter that you'll be using in your workspace. You can force a specific Python version by appending either FME_PYTHON_VERSION 27 or FME_PYTHON_VERSION 37 at the end of the command, e.g.

fme.exe python -m pip install geemap --target .x] FME_PYTHON_VERSION 37

 

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target dx] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to Âx] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

If you defined fx] correctly when installing the module, FME should take care of the rest for you, and you should not need to refer to it anymore.

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Thanks for your help so far David :)

Not sure how FME knows where ox] is, seeing as it is a custom folder I specified in the cmd install. I now attempt to install the package in FME like so:

 try:
        import geemap
    except ImportError:
        print("Installing geemap ...")
        subprocess.check_call( "fme.exe", "python", "-m", "pip", "install", "geemap", "--target", "Q:\K\EIN\BU500\Algemeen\Afstudeer\tropomi\geemap"])

When  I run the script above, I get the following error...error

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Âx] should refer to a folder that is known to FME, e.g. 

C:\Users\<username>\Documents\FME\Plugins\Python\python38 for Python 3.8 modules.

See also https://docs.safe.com/fme/html/FME_Desktop_Documentation/FME_Workbench/Workbench/Installing-Python-Packages.htm

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Yes, that link is where I got the code in my first post, but I am trying to install it to a folder accessible by my network. I need this workspace to run from any PC that has access to tx], is this possible? I am trying to avoid everyone having to install the package to their own PC. 

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

It should be doable, if you add something like the following at the top of every Python code block that imports the "geemap" module, before the "import geemap" statement:

import sys
geemap_path = "rx]"
if not geemap_path in sys.path:
    sys.path.append(geemap_path)

Basically it adds Âx] to the Python search path, if not already present.

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Hmm, I tried this but got this error. Which hints at an incomplete geemap install (?)

Python Exception <ModuleNotFoundError>: No module named 'ee'

How can I best install the geemap package to ox] within the script in FME? Is there anyway to do this?

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Did you watch out for the \ character?

Either it needs to be doubled, e.g. 

geemap_path = "c:\\temp\\modules\\geemap"

Or you'll need to tell Python that it's a raw string by prefixing it by a lower case "r", e.g.

geemap_path = r"c:\temp\modules\geemap"

 

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Good point. I have added the double backslash.

If I run the code below, I get the following error: 

Python Exception <ImportError>: cannot import name 'Box' from 'box' (C:\Program Files\FME\python\python38\box\__init__.pyc)

Have you seen this error before?

The code I am now running:

class TROPOMI(object):
    import sys
    geemap_path = "C:\\Users\\ollih\\Desktop\\geemap"
    if not geemap_path in sys.path:
        sys.path.append(geemap_path)
 
    import fme
    import fmeobjects
    import ee
    import geemap
    import os
 
    ee.Initialize()
 
    countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
    NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
 
    feature.getAttribute('tropomi_product')
 
 
    roi = NL.geometry()
 
    out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
    filename = os.path.join(out_dir, 'export.tif')
 
    image = image.clip(roi).unmask()
    geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

Ah, I mistook command shell code as Python code. I now ran this:

fme.exe python -m pip install geemap --target  x] FME_PYTHON_VERSION 38

in cmd and it seems to have installed the necessary dependencies. 

 

How can I refer to px] when trying to run this Python Script in FME?

import ee
import geemap
import os
 
ee.Initialize()
 
countries = ee.FeatureCollection("FAO/GAUL/2015/level0")
NL = countries.filterMetadata('ADM0_NAME', 'equals', 'Netherlands')
image = ee.ImageCollection('COPERNICUS/S5P/OFFL/L3_NO2') \
  .select('tropospheric_NO2_column_number_density') \
  .filterDate('2019-06-02', '2019-06-03') \
  .mean()
 
roi = NL.geometry()
 
out_dir = os.path.join(os.path.expanduser('~'), 'Downloads')
filename = os.path.join(out_dir, 'NO2.tif')
 
image = image.clip(roi).unmask()
geemap.ee_export_image(image, filename=filename, scale=2000, region=roi, file_per_band=False)

 

My first impression is a missing requirement or a dependency, or perhaps even some namespace problem. I can't really tell without further knowledge of the other modules.

Are you using a BoxConnector transformer somewhere in your workspace? The problem seems to be related to that.

Reply


Community Stats

30,212
Posts
114,659
Replies
37,867
Members
Terms & ConditionsCookie settings
A product of
Safe Software respectfully acknowledges that we live, learn and work on the traditional and unceded territories of the Kwantlen, Katzie, and Semiahmoo First Nations.